El Consell Assessor Científic i Pedagògic és l'òrgan de consulta i assessorament del Consorci.
Les funcions de secretaria del Consell Assessor Científic i Pedagògic les assumeix la secretaria del Consorci i són les següents:
El Consell Assessor Científic i Pedagògic adopta els seus acords per majoria simple, i el seu funcionament es regeix per la normativa aplicable als òrgans col·legiats de les administracions públiques de Catalunya i pel seu reglament intern.
Així mateix, el Consell pot crear comissions específiques, de caràcter temporal, per a l'estudi d'assumptes determinats.
El Consell Assessor Científic i Pedagògic és l’òrgan de consulta i assessorament del Consorci i està integrat per entre 10 i 14 persones de reconegut prestigi professional en les activitats que són objecte del Museu Memorial de l’Exili.
Els vocals del Consell Assessor Científic i Pedagògic, la presidència del qual l’exercirà el/la director/a, són designats pel Consell d’Administració a proposta de la Universitat de Girona i de la direcció general competent en matèria de memòria democràtica.
Les funcions de secretaria del Consell Assessor Científic i Pedagògic són assumides pel secretari o secretària del Consorci.