El Consell d'Administració té les funcions següents:

a) Designar i decidir el cessament dels membres del Consell Assessor Científic i Pedagògic a proposta de la Universitat de Girona i de la direcció general competent en matèria de memòria democràtica.

b) Fiscalitzar els òrgans de govern i administració.

c) Modificar els Estatuts.

d) Admetre nous ens consorciats.

e) Aprovar el projecte museístic i les seves modificacions, amb l’informe previ del Consell Assessor Científic i Pedagògic.

f) Aprovar el reglament intern.

g) Aprovar les tarifes dels serveis del Consorci.

h) Aprovar i modificar el pressupost, la plantilla de personal i aprovar els comptes.

i) Aprovar les aportacions econòmiques dels ens consorciats.

j) Contractar obres, serveis públics i subministraments, inclosos els contractes de caràcter plurianual, a partir de la quantia per a la qual s’hagi habilitat el/la director/a.

k) Adquirir, alienar, gravar i gestionar els béns de domini públic i patrimonials.

l) Ampliar el nombre d’anualitats i la modificació de percentatges de despeses plurianuals, i la concertació de crèdits d’acord amb el pressupost i les bases d’execució.

m) Desplegar la gestió econòmica, autoritzar, i disposar les despeses en matèria de la seva competència.

n) Aprovar la relació de llocs de treball.

o) Aprovar l’organització interna de l’administració del Consorci.

p) Exercir accions administratives i judicials en matèria de la seva competència.

q) Dissoldre i liquidar el Consorci.

El règim de funcionament del Consell d’Administració és el règim aplicable als òrgans col·legiats previst en la legislació de règim jurídic i de procediment de les administracions públiques de Catalunya.

El Consell d’Administració està integrat per tres representants de l’Ajuntament de la Jonquera, tres representants nomenats pel Govern de la Generalitat a proposta del departament competent en matèria de memòria democràtica, dos representants del Consell Comarcal de l’Alt Empordà i un representant de la Universitat de Girona. També hi assisteix amb veu, però sense vot, el director o directora. 

Amb independència del nombre de representats, el valor del vot dels representants de les entitats consorciades és el següent:

a) l’Ajuntament de la Jonquera: 4 vots.

b) l’Administració de la Generalitat: 8 vots.

c) el Consell Comarcal de l’Alt Empordà: 2 vots.

d) la Universitat de Girona: 1 vot.

La presidència i la vicepresidència del Consell d’Administració recauen en la presidència i la vicepresidència del Consorci.

La secretaria del Consell d’Administració és exercida per un vocal del mateix òrgan o per una persona al servei del Consorci. El secretari o secretària és nomenat/ada pel/per la president/a.

• ACORD GOV/126/2021, de 3 d'agost, pel qual es nomenen els representants de l'Administració de la Generalitat de Catalunya al Consell d'Administració del Consorci del Museu Memorial de l'Exili (MUME). (DOGC núm. 8473)
  
  
• ACORD GOV/93/2021, de 29 de juny, pel qual es nomena la vicepresidència del Consorci del Museu Memorial de l'Exili (MUME). (DOGC núm. 8446)
  
  
• ACORD GOV/43/2015, de 24 de març, pel qual s'aprova la modificació dels estatuts de determinats consorcis, amb participació majoritària de la Generalitat de Catalunya. (DOGC núm. 6839)