La Comissió és presidida per la persona titular de la direcció general competent en matèria d'agricultura i ramaderia, i està integrada per les persones titulars de les direccions generals, ens o entitats de la Generalitat que s'indiquen a continuació:
- Direcció general competent en matèria de qualitat ambiental, a qui correspon la vicepresidència.
- Direcció general competent en matèria d'energia.
- Direcció general competent en matèria d'afers interdepartamentals.
- Agència de Residus de Catalunya.
- Agència Catalana de l'Aigua.
- Institut Català d'Energia.
- Oficina Catalana del Canvi Climàtic.
- Agència de Salut Pública de Catalunya.
- Un secretari o secretària, amb veu però sense vot, que ha de ser una persona funcionària de la direcció general competent en matèria d'agricultura i ramaderia.