El Servei d'Estructures de Recerca té les funcions següents:
a) Donar suport a la Subdirecció General en el desplegament de la política de recerca, especialment donant suport i assistència als centres de recerca, grans instal·lacions científiques i altres estructures.
b) Elaborar i proposar contractes programa amb els centres de recerca i les institucions científiques i coordinar-se amb la Institució dels Centres de Recerca de Catalunya (I-CERCA) per a la seva aplicació pel que fa als centres de recerca.
c) Fer la formació, la coordinació i el desenvolupament professional de la gestió de la recerca dels centres de recerca.
d) Planificar les inversions als centres de recerca i fer-ne el seguiment, en coordinació amb el Servei de Programes i el Servei de Planificació i Gestió de la Recerca.
e) Gestionar el finançament necessari als centres de recerca, grans instal·lacions científiques i altres institucions.
f) Qualsevol altra funció de naturalesa anàloga que li sigui encomanada.